深圳公司法人變更可以通過線上全流程或線下窗口兩種方式辦理，具體流程如下：

1. 召開股東會：公司需召開股東會或股東大會，就法人變更事宜形成決議，該決議需經代表三分之二以上表決權的股東通過，明確新法人人選。
2. 準備材料：
   1. 申請書：法定代表人簽署的《公司變更（備案）登記申請書》，并加蓋公司公章。
   1. 委托證明：《指定代表或者共同委托代理人的證明》，同樣需加蓋公司公章，并提供指定代表或委托代理人的身份證件復印件。
   1. 任免證明：根據(jù)公司章程的規(guī)定和程序，提交原法定代表人的免職證明和新任法定代表人的任職證明原件。
   1. 身份證明：新任法定代表人的身份證件復印件。
   1. 章程修改文件：法定代表人變更涉及公司章程修改的，應提交關于修改公司章程的決議、決定以及修改后的公司章程或者公司章程修正案，由公司法定代表人簽署。
   1. 特殊情況材料：若法律、行政法規(guī)和國務院決定規(guī)定變更法定代表人必須報經批準，需提交有關的批準文件或者許可證書復印件。
   1. 營業(yè)執(zhí)照：公司營業(yè)執(zhí)照正、副本原件。
3. 提交申請：
   1. 線上辦理：登錄深圳市市場監(jiān)督管理局官網，進入商事主體登記注冊相關系統(tǒng)，按系統(tǒng)提示填寫法人變更等相關信息，并上傳準備好的材料。內資公司符合網上全流程的需全流程辦理，填寫完變更信息提交后，下載未簽名的申請表，進行電子簽名提交。
   1. 線下辦理：若不滿足線上全流程條件或外資公司，需預約深圳市市場監(jiān)督管理局的窗口辦理，前往指定窗口提交紙質申請材料。
4. 審核：登記機關會對申請材料進行審核，若材料齊全、符合法定形式，將予以受理；若材料存在問題，會通知申請人補充或修改。
5. 領取新執(zhí)照：審核通過后，申請人可在規(guī)定時間內前往登記機關領取新的營業(yè)執(zhí)照，或選擇郵寄送達，此時法人變更正式完成。
6. 辦理其他事項變更：法人變更后，還需前往稅務部門變更稅務登記信息，到開戶銀行辦理銀行賬戶信息變更等，涉及其他相關證件上法定代表人信息變更的，也需到相應部門辦理變更手續(xù)。